Во время пролёта около Нептуна аппарат Вояджер-2 установил, что на этой планете достаточно активная динамика атмосферы: ветры бушующие со скоростью до 2100 км/ч., это самые быстрые ветры в Солнечной системе.



Также Вояджер сделал множество снимков, на одном из которых видно Большое Тёмное Пятно (по аналогии с БКП на Юпитере), множество высоких рельефных облаков, и Малое Тёмное Пятно ближе к южному полюсу планеты. В отличие от Юпитера с его Большим Красным Пятном, которое бушует уже, как минимум несколько столетий, на Нептуне же подобные штормовые образования не так долговечны. В 1994 году было объявлено об исчезновении Большого Тёмного Пятна.